بازسازی تاسیسات آبی و خاکی کشاورزی شامل قنوات، انهار سنتی و کانال‌های آبیاری، بندهای آبخیزداری و استخرهای پرورش ماهی، جاده‌های دسترسی، مزارع و باغات، جایگاه دام، واحدهای مرغداری، تامین علوفه و اقدامات دامپزشکی از مهم‌ترین اقداماتی است که برای امدادرسانی به کشاورزان و دامپروران مناطق سیل زده در دستور کار قرار دارد. عمده خسارت‌های وارده به بخش کشاورزی در شهرستان‌های کنارک، نیکشهر، چابهار، قصرقند، دلگان، مهرستان، سرباز، بمپور، فنوج، سیب و سوران و خاش بوده است. همچنین به علت بسته شدن جاده‌های دسترسی، درحال‌حاضر تعیین خسارت قطعی امکان‌پذیر نیست و بررسی‌های اولیه گروه‌های تعیین خسارت، میزان خسارات وارده به زیربخش‌های کشاورزی را حدود ۶۴۰ میلیارد تومان برآورد کرده‌اند.
در عین حال، مدیرکل دفتر مدیریت بحران و کاهش مخاطرات بخش کشاورزی خسارات وارده به ۳ استان را اعلام کرده است. به گفته سیدمحمد موسوی، در پی وقوع سیل اخیر، حدود هزار میلیارد تومان خسارت به بخش کشاورزی ۳ استان سیستان و بلوچستان، هرمزگان و کرمان وارد شده است. به گزارش خبرگزاری مهر، مدیرکل دفتر مدیریت بحران و کاهش مخاطرات بخش کشاورزی درباره اقدامات انجام شده حین سیل توسط وزارت جهاد کشاورزی اظهار کرد: توزیع ۵۱۰ تن علوفه، جابه‌جایی ۲۱ هزار راس دام، دفن بهداشتی ۷۰۰ راس دام، تخلیه آب ۶۰۰ هکتار اراضی کشاورزی، تامین ۱۰ کیلومتر لوله پلی اتیلن برای انتقال آب اضطراری اراضی کشاورزی، مرمت ۲۰ کیلومتر جاده‌های بین مزارع از جمله اقدامات وزارت جهادکشاورزی از زمان وقوع سیل تاکنون بوده است. وی افزود: همچنین پیشنهاد طرح و تصویب تامین منابع جبران خسارات و بازسازی زیرساخت‌ها برای ارائه در هیات دولت تهیه و به وزارت کشور و سازمان برنامه و بودجه کشور ارسال شده است.